Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ephb3P54754 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms