Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacnb3P54285 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms