Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms