Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map3k1P53349 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms