Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms