Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd1P52734 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms