Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms