Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pold1P52431 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pold1P52431 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms