Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms