Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspoP50637 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspoP50637 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TspoP50637 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TspoP50637 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TspoP50637 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TspoP50637 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TspoP50637 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms