Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pa2g4P50580 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pa2g4P50580 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms