Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms