Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms