Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms