Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnni3P48787 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms