Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx3P48759 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms