Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prox1P48437 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms