Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VdrP48281 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VdrP48281 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VdrP48281 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VdrP48281 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VdrP48281 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VdrP48281 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VdrP48281 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VdrP48281 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms