Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpiaP47968 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpiaP47968 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpiaP47968 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms