Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms