Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl6P47911 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl6P47911 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms