Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gli1P47806 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms