Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms