Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd4P46935 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms