Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms