Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtgirP43252 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms