Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf5P43027 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf5P43027 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf5P43027 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf5P43027 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf5P43027 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf5P43027 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms