Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LifrP42703 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifrP42703 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LifrP42703 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LifrP42703 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LifrP42703 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifrP42703 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifrP42703 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LifrP42703 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifrP42703 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifrP42703 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifrP42703 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifrP42703 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifrP42703 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms