Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-2P42580 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms