Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms