Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms