Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps26aP40336 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms