Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms