Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp4P35123 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms