Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf8P32972 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf8P32972 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms