Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms