Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms