Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc10P31257 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc10P31257 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms