Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcdP28867 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms