Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprmP28828 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprmP28828 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprmP28828 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprmP28828 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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