Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NapbP28663 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NapbP28663 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NapbP28663 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NapbP28663 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NapbP28663 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NapbP28663 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NapbP28663 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NapbP28663 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NapbP28663 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NapbP28663 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NapbP28663 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NapbP28663 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NapbP28663 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NapbP28663 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NapbP28663 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NapbP28663 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NapbP28663 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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