Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms