Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af2P26369 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af2P26369 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U2af2P26369 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms