Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChgaP26339 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChgaP26339 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChgaP26339 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChgaP26339 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChgaP26339 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms