Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tsta3P23591 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms