Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3aP23116 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms