Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp36P22893 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms