Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb9P20615 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms