Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NefhP19246 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NefhP19246 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NefhP19246 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NefhP19246 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NefhP19246 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NefhP19246 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NefhP19246 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms