Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms